logo
Медицинский вестник
Северного Кавказа
Научно-практический журнал
Зарегистрирован в Федеральной службе
по надзору за соблюдением законодательства
в сфере массовых коммуникаций
и охране культурного наследия
ПИ №ФС77-26521 от 7 декабря 2006 года
ISSN 2073-8137
rus
русский
eng
english

Поиск по сайту




Адрес редакции
355017, Ставрополь, улица Мира, 310.

Телефоны
(8652) 35-25-11, 35-32-29.

E-mail
medvestnik@stgmu.ru

Рейтинг@Mail.ru

Pseudomonas aeruginosa. Ассистенты и конкуренты в микробиоме инфицированных легких больных муковисцидозом

[Муковисцидоз]
Воронина Ольга Львовна; Рыжова Наталья Николаевна; Кунда Марина Сергеевна; Аксенова Екатерина Ивановна; Зигангирова Наиля Ахатовна; Капотина Лидия Николаевна; Сайдакова Станислава Андреевна; Данилина Галина Алексеевна;

Pseudomonas aeruginosa является самым актуальным патогенным микроорганизмом при муковисцидозе (МВ). Целью работы было исследование цитотоксичности изолятов P. aeruginosa, выделенных от российских пациентов с МВ, и анализ сопряжения наличия псевдомонадной инфекции с клиническими показателями пациентов и составом микробиоты. В выборке из 751 пациента P. aeruginosa выявлен у 45 %. 84 % изолятов с различными генотипами относились к ExoS-типу, характеризуя множественность и независимость источников заражения больных МВ. Выявление 7 ExoU изолятов, 5 из которых (ST235 и ST313) с высокой цитотоксичностью, подтверждает опасность инфицирования больных МВ внутрибольничными штаммами. Анализ микробиома легких показал, что P. aeruginosa находится в конкурентных отношениях с основными представителями «здорового» бактериома (Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes), а также с микоплазмой и рядом таксонов Proteobacteria. Вместе с этим присутствие P. aeruginosa положительно коррелирует с грибами, энтеробактериями и моракселлой. Исследование сопряжения клинических показателей с составом микробиома подтверждает необходимость разработки антибактериального препарата избирательного действия в отношении патогенных для больных МВ микроорганизмов.

Скачать

Список литературы:
1. European Cystic Fibrosis Society Patient Registry Annual Data Report 2017. Zolin A., Orenti A., Naehrlich L., van Rens J., Fox A. [et al.]. 2019. Available at: https://www.ecfs.eu/projects/ecfs-patient-registry/annual-reports. Accessed January 21, 2020.
2. Cystic Fibrosis Foundation (US) Patient Registry Annual Data Report 2017. Available at: https://www.cff.org/. Accessed January 21, 2020.
3. Brazilian Cystic Fibrosis Patient Registry 2011 Annual Report. Available at: http://www.cysticfibrosisdata.org/data-registry/brazilian-cystic-fibrosis-registry. Accessed January 21, 2020.
4. Регистр больных муковисцидозом в Российской Федерации. 2017 год. Под ред. А. Ю. Воронковой, Е. Л. Амелиной, Н. Ю. Каширской, Е. И. Кондратьевой, С. А. Красовского [и др.]. М.: ИД Медпрактика-М, 2019.
5. Freschi L., Jeukens J., Kukavica-Ibrulj I., Boyle B., Dupont M. J. [et al.]. Clinical utilization of genomics data produced by the international Pseudomonas aeruginosa consortium. Front. Microbiol. 2015;6:1036. https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.01036
6. Jeukens J., Emond-Rheault J. G., Freschi L., Kukavica-Ibrulj I., Levesque R. C. Major Release of 161 Whole-Genome Sequences from the International Pseudomonas Consortium Database. Microbiol. Res. Ann. 2019;8(13):e00013-19. https://doi.org/10.1128/MRA.00013-19
7. Ozer E. A., Nnah E., Didelot X., Whitaker R. J., Hauser A. R. The Population Structure of Pseudomonas aeruginosa Is Characterized by Genetic Isolation of exoU+ and exoS+ Lineages. Genome Biol. Evol. 2019;11(1):1780-1796. https://doi.org/10.1093/gbe/evz119
8. Finck-Barbançon V., Goranson J., Zhu L., Sawa T., Wiener-Kronish J. P. [et al.]. ExoU expression by Pseudomonas aeruginosa correlates with acute cytotoxicity and epithelial injury. Mol. Microbiol. 1997;25(3):547-557. https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1997.4891851.x
9. Enninga J., Rosenshine I. Imaging the assembly, structure and activity of type III secretion systems. Cell Microbiol. 2009;11(10):1462-1470. https://doi.org/10.1111/j.1462-5822.2009.01360.x
10. Ballarini A., Scalet G., Kos M., Cramer N., Wiehlmann L. [et al.]. Molecular typing and epidemiological investigation of clinical populations of Pseudomonas aeruginosa using an oligonucleotide-microarray. BMC Microbiol. 2012;12:152. https://doi.org/10.1186/1471-2180-12-152
11. Voronina O. L., Kunda M. S., Ryzhova N. N., Aksenova E. I., Sharapova N. E. [et al.]. On Burkholderiales Order Microorganisms and Cystic Fibrosis in Russia. BMC Genomics. 2018,19(Suppl 3):74. https://doi.org/10.1186/s12864-018-4472-9
12. Voronina O. L., Ryzhova N. N., Kunda M. S., Loseva E. V., Aksenova E. I. [et al.]. Characteristics of the Airway Microbiome of Cystic Fibrosis Patients. Biochemistry. 2020;85(1):1-10. https://doi.org/10.1134/S0006297920010010
13. Telenti A., Marchesi F., Balz M., Bally F., Böttger E. C. [et al.]. Rapid identification of mycobacteria to the species level by polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis. J. Clin. Microbiol. 1993;31(2):175-178.
14. Симонова О. И., Воронина О. Л., Горинова Ю. В., Амелина Е. Л., Буркина Н. И. [и др.]. Особенности лечения пациента с муковисцидозом при смешанном микробном инфицировании органов дыхания, в том числе, Pandoraea pnomenusa. Российский педиатрический журнал. 2016;19(2):113-122.
15. Ajayi T., Allmond L. R., Sawa T., Wiener-Kronish J. P. Single-nucleotide polymorphism mapping of the Pseudomonas aeruginosa type III secretion toxins for development of a diagnostic multiplex PCR system. J. Clin. Microbiol. 2003;41(8):3526-3531.
16. Sheremet A. B., Zigangirova N. A., Zayakin E. S., Luyksaar S. I., Kapotina L. N. [et al.]. Small Molecule Inhibitor of Type Three Secretion System Belonging to a Class 2,4-disubstituted-4H-[1,3,4]-thiadiazine-5-ones Improves Survival and Decreases Bacterial Loads in an Airway Pseudomonas aeruginosa Infection in Mice. Biomed. Res. Int. 2018;2018:5810767. https://doi.org/10.1155/2018/5810767
17. Quanjer P. H., Stanojevic S., Cole T. J., Baur X., Hall G. L. [et al.]. ERS Global Lung Function Initiative. ERS TASK FORCE REPORT. Multi-ethnic reference values for spirometry for the 3–95-yr age range: the global lung function 2012 equations. Eur. Respir. J. 2012;40:1324-1343.
18. Quanjer P. H., Stanojevic S., Cole T. J., Stocks J. Implementing GLI-2012 regression equations. Available at: http://www.ers-education.org/guidelines/global-lung-function-initiative/gli-2012-explained.aspx. Accessed January 21, 2020.
19. Чучалин А. Г., Айсанов З. Р., Чикина С. Ю., Черняк А. В., Калманова Е. Н. Федеральные клинические рекомендации Российского респираторного общества по использованию метода спирометрии. Пульмонология. 2014;(6):11-24. https://doi.org/10.18093/0869-0189-2017-0-3
20. Addinsoft. XLSTAT statistical and data analysis solution. New York, USA. (2019). Available at: https://www.xlstat. com. Accessed January 21, 2020.
21. Chowdhary A., Randhawa H. S., Gaur S. N., Agarwal K., Kathuria S. [et al.]. Schizophyllum commune as an emerging fungal pathogen: a review and report of two cases. Mycoses. 2013;56(1):1-10. https://doi.org/10.1111/j.1439-0507.2012.02190.x
22. Singh A., Ralhan A., Schwarz C., Hartl D., Hector A. Fungal Pathogens in CF Airways: Leave or Treat? Mycopathologia. 2018;183(1):119-137. https://doi.org/10.1007/s11046-017-0184-y
23. Рыжова Н. Н., Воронина О. Л., Лосева Э. В., Аксенова Е. И., Кунда М. С. [и др.]. Микробиом респираторного тракта детей с муковисцидозом. Сибирское медицинское обозрение. 2019;(2):19-28. https://doi.org/10.20333/2500136-2019-2-19-28

Ключевые слова: Pseudomonas aeruginosa, цитотоксичность, микробиом, актинобактерии, грибы, спирометрия


Учредители:
Ставропольская государственная медицинская академия
Государственный научно-исследовательский институт курортологии
Пятигорская государственная фармацевтическая академия