logo
Медицинский вестник
Северного Кавказа
Научно-практический журнал
Зарегистрирован в Федеральной службе
по надзору за соблюдением законодательства
в сфере массовых коммуникаций
и охране культурного наследия
ПИ №ФС77-26521 от 7 декабря 2006 года
ISSN 2073-8137
rus
русский
eng
english

Поиск по сайту




Адрес редакции
355017, Ставрополь, улица Мира, 310.

Телефоны
(8652) 35-25-11, 35-32-29.

E-mail
medvestnik@stgmu.ru

Рейтинг@Mail.ru

Молекулярно-генетическое типирование возбудителей острых кишечных инфекций бактериальной и вирусной этиологии, выявленных на территории Ставропольского края в 2016 году

[Инфекционные болезни]
Чекрыгинав Елена Владимировна; Волынкина Анна Сергеевна; Котенев Егор Сергеевич; Васильева Оксана Васильевна; Куличенко Александр Николаевич;

Приведены результаты субвидового генетического типирования штаммов и изолятов нуклеиновых кислот возбудителей ОКИ бактериальной и вирусной этиологии, выявленных на территории Ставропольского края в 2016 году. Выполнен MLVA-анализ 36 штаммов S. enteritidis, генетическое типирование 16 изолятов РНК ротавирусов, 3 энтеровирусов, 2 норовирусов. Исследуемые штаммы S. enteritidis отличались высокой генетической гетерогенностью и относились к 11 MVLA-генотипам. Выявлены ротавирусы, принадлежащие генотипам: G4[P8] (68,7 %), G2[P4] (18,8 %), G9[P8] (12,5 %), норовирусы GII.Pe-GII.4_Sydney_2012 и GII.P16-GII.4_Sydney_2012, энтеровирусы Echovirus 5 и Echovirus 3. На основании результатов генетической идентификации изолятов возбудителей ОКИ проведена оценка их эпидемиологической значимости и определены особенности региональных штаммов возбудителей ОКИ. Полученные данные могут быть использованы при эпидемиологическом анализе спорадических случаев и эпидемических вспышек ОКИ в Ставропольском крае.

Скачать

Список литературы:
1. Hopkins K. L., Peters T. M., de Pinna E., Wain J. Standardisation of multilocus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA) for subtyping of Salmonella enterica serovar Enteritidis. Euro Surveill. 2011;16(32):19942. https://doi.org/10.2807/ese.16.32.19942-en
2. Nirwati H., Hakim M. S., Aminah S., Dwija I.B.N.P., Pan Q., Aman A. T. Identification of Rotavirus Strains Causing Diarrhoea in Children under Five Years of Age in Yogyakarta, Indonesia. The Malaysian Journal of Medical Sciences: MJMS. 2017;24(2):68-77. https://doi.org/10.21315/mjms2017.24.2.9
3. Vicentini F., Denadai W., Gomes Y. M., Rose T. L., Ferreira M. S. [et al.]. Molecular Characterization of Noroviruses and HBGA from Infected Quilombola Children in Espirito Santo State, Brazil. Ren X, ed. PLoS ONE. 2013;8(7):e69348. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0069348
4. Puustinen L., Blazevic V., Huhti L., Szakal E. D., Halkosalo A. [et al.]. Norovirus genotypes in endemic acute gastroenteritis of infants and children in Finland between 1994 and 2007. Epidemiology and Infection. 2012;140(2):268-275. https://doi.org/10.1017/S0950268811000549
5. Nix W. A., Oberste M. S., Pallansch M. A. Sensitive, Seminested PCR Amplification of VP1 Sequences for Direct Identification of All Enterovirus Serotypes from Original Clinical Specimens. Journal of Clinical Microbiology. 2006;44(8):2698-2704. https://doi.org/10.1128/JCM.00542-06
6. Bertrand S., De Lamine de Bex G., Wildemauwe C., Lunguya O., Phoba M. F. [et al.]. Multi Locus Variable-Number Tandem Repeat (MLVA) Typing Tools Improved the Surveillance of Salmonella Enteritidis: A 6 Years Retrospective Study. Friedrich A, ed. PLoS ONE. 2015;10(2):e0117950. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0117950
7. Зайцева Е. В., Ольнева Т. А., Кулешов К. В., Кондратьева Л. М., Шихина Т. М. [и др.]. Результаты мониторинга антигенных типов ротавирусов группы А на территории Российской Федерации в период 2011–2015 гг. Клиническая лабораторная диагностика. 2016;61(7):445-448. https://doi.org/10.18821/0869-2084-2016-61-7-445-448
8. Veselova O. A., Podkolzin А., Petukhov D., Kuleshov K., Shipulin G. Rotavirus Group a Surveillance and Genotype Distribution in Russian Federation in Seasons 2012–2013. Int. J. Clin. Med. 2014;5(7):407-413. https://doi.org/10.4236/ijcm.2014.57055
9. van Beek J., Ambert-Balay K., Botteldoorn N., Eden J. S., Fonager J. [et al.]. Indications for worldwide increased norovirus activity associated with emergence of a new variant of genotype II.4, late 2012. Euro Surveill. 2013;18(1):20345. https://doi.org/10.2807/ese.18.01.20345-en
10. Голицына Л. Н., Зверев В. В., Парфенова О. В., Новикова Н. А. Эпидемические варианты неполиомиелитных энтеровирусов в России. Медицинский альманах. 2015:5(40):136-140.

Ключевые слова: генетическое типирование, острые кишечные инфекции, Ставропольский край


Учредители:
Ставропольская государственная медицинская академия
Государственный научно-исследовательский институт курортологии
Пятигорская государственная фармацевтическая академия